В БФУ Матвеев курировал вопросы информатизации, участвовал в разработке стратегии развития и программы развития федерального университета, прокомментировали в Калининграде сегодня, 30 января 2017 года, ИА Бесспорно RU в БФУ имени Канта.
В 2016 году он был назначен исполняющим обязанности начальника департамента науки и технологий федерального министерства. Ранее он работал заместителем начальника департамента.
Матвеев принимал активное участие в работе над Стратегией научно-технологического развития РФ, которая 1 декабря 2016 года утверждена президентом Владимиром Путиным.